Lab Akademi Soru&Cevap Platformu
2 beğenilme 0 beğenilmeme
15 kez görüntülendi

Merhaba;

İki farklı ilaç molekülü ile çalışıyorum. Hedefim Gaussian 09 kullanarak gaz fazı ile solvent fazı (solvent = su) arasındaki çözünme enerjisi farkını bulmak. 

Örnek olarak aşağıdaki şekilde ölçebilirim: 

1. Gaz fazı yapısını (scrf anahtar sözcüğü olmadan) frekans hesaplaması ile optimize edebilirim. 

2. Sonra, gaz fazı optimize edilmiş yapısıyla (1'den itibaren bulunan) ve yapıyı daha fazla optimize etmeden, frekans hesaplamalı scrf (cpm smd dovacuum solvent = h2o) anahtar kelimeleri kullanarak sadece tek noktadan enerji hesaplaması yapabilirim. O zaman enerjiyi karşılaştırabilirim. Delta-G değerini doğrudan bu hesaplamadan alabilirim. Bu delta-G kavitasyon enerjisi nedir? 

3. scrf (cpcm solvent = h2o) ve scrf (pcm smd dovacuum solvent = h2o) kullanarak yapıyı optimize edebilir ve sonra enerji farkını bulabilir miyim? Bu durumda, delta-G neyi temsil eder? Doğru yol bu mudur? Bu konuda net bir fikir alabilir miyim? 

Tüm bilgiler için şimdiden teşekkür ederim.

Analiz Yöntemleri kategorisinde (180 puan) tarafından soruldu | 15 kez görüntülendi

Bu soruya cevap vermek için lütfen giriş yapınız veya kayıt olunuz.

Hoş geldiniz; Lab Akademi Soru&Cevap platformu sizlere sorularınızın diğer kullanıcılarımız tarafından cevaplanması için bir ortam sağlar.
148 soru
106 cevap
19 yorum
354 kullanıcı