HPLC kolonları kullanılan MP ve ürünlere göre değişiklik gösterebilir fakat şekerli ürün ise kolon gerekirse tersten bile yıkanmalı çünkü kolonun ömrü kısalıyor. MP tampon pH lı ise de kolon yıkanmalı yıkanmadığı taktirde kolon tuz bağlar ve kolon yüksek basınç vereceği için analize başlanılmaz